evolutionary origin and phylogenetic relationships among fusarium oxysporum f. sp. melonis isolates in iran and their relationship with nonpathogenic isolates

thesis
abstract

پژمردگی فوزاریومی خربزه و طالبی با عامل fusarium oxysporum f. sp. melonis از بیماری های مهم قارچی در مناطق رشد این گیاهان می باشد. جدایه های f. oxysporum از گیاهان و خاک ریزوسفر متعلق به پنج استان مهم تولیدکننده ی خربزه و طالبی جداسازی شد و بر پایه ی بیماری زایی در ارقام افتراقی، گروه های سازگاری رویشی (vegetative compatibility groups)، توالی سنجی ناحیه ی جداکننده ی بین ژنی دی اِن اِی ریبوزومی (nuclear ribosomal dna intergenic spacer region)، ژن امتداد ترجمه ی یک آلفا (translation elongation factor-1? gene) و rep-pcr با استفاده از آغازگر rep مورد بررسی قرار گرفتند. نود جدایه از صد جدایه ی بدست آمده در این مطالعه متعلق به نژاد 2,1 بودند که اغلب آن ها دارای گروه سازگاری رویشی 134 و تعداد کمی از آن ها متعلق به یک گروه سازگاری رویشی نامشخص بودند. جدایه های اخیر برپایه ی توالی سنجی ناحیه ی جداکننده ی بین ژنی دی اِن اِی ریبوزومی و ژن امتداد ترجمه ی یک آلفا با جدایه ی دارای گروه سازگاری رویشی 135 در یک گروه قرار گرفتند. ده جدایه ی باقی مانده با دو گروه سازگاری رویشی توصیف نشده، روی خربزه و طالبی غیربیمارگر بودند. نه لاین همسان بر پایه ی توالی سنجی ناحیه جداکننده ی بین ژنی دی اِن اِی ریبوزومی در بین جدایه های خارجی و ایرانی تشخیص داده شده که هر کدام متعلق به یک گروه سازگاری رویشی بودند. تفکیک گروه های سازگاری رویشی به لاین های جدا برپایه ی توالی سنجی ناحیه ی جداکننده ی بین ژنی دی اِن اِی ریبوزومی، در اغلب موارد با نتایج توالی سنجی ژن امتداد ترجمه ی یک آلفا هماهنگ بود. اما گروه های سازگاری رویشی 130 و 131 استثناء بودند که تنها با توالی سنجی ناحیه ی جداکننده بین ژنی دی اِن اِی ریبوزومی و نه با توالی سنجی ژن امتداد ترجمه ی یک آلفا و rep-pcr از یکدیگر تفکیک شدند. نژادهای مختلف از آمریکا، فرانسه و ایران با گروه سازگاری رویشی 134 برپایه ی توالی سنجی ناحیه ی جداکننده ی بین ژنی دی اِن اِی ریبوزومی و ژن امتداد ترجمه ی یک آلفا در یک گروه قرار گرفتند در حالی که براساس نتایج rep-pcr به سه هاپلوتیپ نزدیک به هم تفکیک شدند و بنابراین پیشنهاد می شود که این گروه سازگاری رویشی از آنچه که قبلاً تصور می شد دارای تنوع بیشتری است. به نظر می رسد با توجه به تاریخچه ی طولانی کشت کدوئیان در ایران و تنوع در جدایه های ایرانی دارای گروه سازگاری رویشی 0134، این گروه سازگاری رویشی احتمالاً در ایران تکامل یافته است. همچنین در این مطالعه رابطه ی تکاملی بین جدایه های مختلف فرم های ویژه (formae speciales) f. oxysporum با تأکید خاص روی f .o. melonis مورد مطالعه قرار گرفت. درخت بدست آمده براساس رهیافت بیشینه ی درست نمایی و آزمون بوت استراپ نشان داد که رابطه ی خاصی بین گروه های سازگاری رویشی f. o. melonis و سایر فرم های ویژه f. oxysporum که توالی ژن امتداد ترجمه ی یک آلفای آن ها از بانک ژن اخذ شده بود، وجود دارد. این نتایج منشا چند نیایی f .o. melonis را حمایت می کند به این معنا که این فرم ویژه به صورت مستقل در چندین زمان تکامل یافته است.

First 15 pages

Signup for downloading 15 first pages

Already have an account?login

similar resources

genetic relationship among fusarium oxysporum f. sp. melonis vegetative compatibility groups and their relatedness to other f. oxysporum formae speciales

fusarium wilt of melon is a destructive fungal disease throughout the world. in this study, the evolutionary relationships among isolates of different formae speciales of fusarium oxysporum was examined, with a special emphasis on the forma specialis melonis. bootstrapped maximum likelihood analysis of the elongation factor-1α (ef-1α) sequence was conducted on 16 iranian and 11 foreign isolates...

full text

Identification of the main toxins isolated from Fusarium oxysporum f. sp. pisi race 2 and their relation with isolates' pathogenicity.

Fusarium oxysporum f. sp. pisi (Fop) is a pathogen of field pea inducing severe vascular wilt worldwide. Plant resistance to races 1, 5, and 6, producing wilt symptoms, is conferred by a single dominant gene, while resistance to race 2, which gives near-wilt symptoms, have been recently showed to be quantitative. Among the virulence factors reported to play a role in the infection process, toxi...

full text

Mycotoxins Biosynthesis by Fusarium Oxysporum and F. Proliferatum Isolates of Asparagus Origin

The subject of this work was fumonisin B1 (FB1) and moniliformin (MON) biosynthesis by three isolates of Fusarium oxysporum and three isolates of F. proliferatum of asparagus spears origin. The cultures of fungi were grown on rice and asparagus media for 3 weeks at 20oC. Experiment was carried out in 3 replicates. FB1 and MON occurrence was evaluated with high-performance liquid chromatography ...

full text

Antagonistic Effect of Nonpathogenic Fusarium oxysporum Fo47 and Pseudobactin 358 upon Pathogenic Fusarium oxysporum f. sp. dianthi.

Pseudobactin production by Pseudomonas putida WCS358 significantly improves biological control of fusarium wilt caused by nonpathogenic Fusarium oxysporum Fo47b10 (P. Lemanceau, P. A. H. M. Bakker, W. J. de Kogel, C. Alabouvette, and B. Schippers, Appl. Environ. Microbiol. 58:2978-2982, 1992). The antagonistic effect of Fo47b10 and purified pseudobactin 358 was studied by using an in vitro bioa...

full text

Recovery of Mutants Impaired in Pathogenicity After Transposition of Impala in Fusarium oxysporum f. sp. melonis.

ABSTRACT The ability of transposon impala to inactivate genes involved in pathogenicity was tested in Fusarium oxysporum f. sp. melonis. Somatic excision of an impala copy inserted in the nitrate reductase-encoding niaD gene was positively selected through a phenotypic assay based on the restoration of nitrate reductase activity. Independent excision events were analyzed molecularly and shown t...

full text

Biochemical characterization of Fusarium oxysporum f. sp. cubense isolates from India

The Fusarium wilt caused by Fusarium oxyspoum f. sp. cubense (Foc) is a major biotic constraint for banana production. The characteristics of F. oxyspoum f. sp. cubense isolates were investigated using electrophoretic studies of isozyme and whole-cell protein. The morphological characteristics of the isolates were very similar to each other. All the Foc isolates were pathogenic to banana cultiv...

full text

My Resources

Save resource for easier access later

Save to my library Already added to my library

{@ msg_add @}


document type: thesis

وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه شیراز - دانشکده کشاورزی

Hosted on Doprax cloud platform doprax.com

copyright © 2015-2023